El rey demonio llamado Sadao está a un paso de conquistar su mundo alternativo cuando se transporta al Tokyo de nuestro mundo. Él termina trabajando a tiempo parcial en un restaurante de comida rápida a fin de mes. Con el fin de conquistar Japón, tiene que dar el primer paso y pasar de un empleado temporal a un empleado completo. Mientras tanto, la heroína Emilia llegó a Japón también, en persecución de Sadao.

Shiki transcurre en un pequeño pueblito llamado Sotoba, localizado en medio de las montañas, donde unas mil trescientas personas vivían en paz hasta que extraños acontecimientos comienzan a suceder: varias personas aparecen muertas, sin razón aparente, y se desatan las sospechas acerca de la presencia de vampiros en la comunidad.

Shinozaki Mikoto es un chico de secundaria, el cual no tiene confianza en si mismo, abusan de él y la suerte con las mujeres le va de mal en peor. Un día se encuentra con una chica de su escuela que trata de animarlo a entrar al Club de Ciclismo, ya que su hermano le dará dinero si recluta gente. ¿Será este un punto de inflexión en la vida de Shinozaki?