El reino de las Cartas es atacado por el grupo Egocéntrico (o Selfish). Su rey, el King Jikochu hace que la gente se convierta en monstruos para destruir la ciudad, pero una pretty cure, Cure Sword, hará todo lo posible para defender su reino, lo cual no puede, entonces decide huir a la ciudad de Clover, pero sus enemigos la persiguen y cuando Sword está a punto de ser derrotada, aparece Cure Heart para salvarla a ella. Ahora, Cure Sword, con la ayuda de otras tres pretty cure: Heart, Diamond y Rosetta tendrán que vencer al Rey Jikochu, buscar a la princesa de dicho reino y volver a restaurar el Reino de las Cartas.
La historia da comienzo cuando la protagonista, Mana Aida, hereda el vestido de boda que llevaron su madre y su abuela. Un hombre misterioso llamado Mashu aparece y ella acaba siendo transportada al pasado. Mana consigue ver de nuevo a su abuela y su perro Maro, pero sus amigas Rikka y Arisu ahora han desaparecido y el futuro acaba hecho un lío.
La historia gira alrededor de dos muchachas, Nagisa Misumi y Honoka Yukishiro, que luchan contra La Zona Dotsuku - una dimensión malvada que usurpó en el Jardín de la Luz. Las acciones de La Zona Dotsuku hicieron necesaria la fuga de dos guardianes del Jardín de la Luz, unas criaturas llamadas Mipple y Mepple. Ellos sirven como fuente de información para la serie, y generalmente se encuentran dentro de los dispositivos de transformación de las chicas, que son parecidos a teléfonos móviles. Durante cortos períodos de tiempo pueden transformarse en sus verdaderos cuerpos e interactuar con los demás. Inicialmente los tienen Cure White y Cure Black mientras buscan las Piedras Prisma, que colocan en un dispositivo conocido como Corazón de Prismas. El Corazón de Prismas es protegido por el Guardián, Wisdom. Una vez descubren todas las Piedras Prisma, su poder las lleva al Jardín de la Luz y repara la mayor parte del daño hecho por La Zona Dotsuku.
Tatsumi es un chico de preparatoria que vive solo. Sin embargo, un apuesto tritón llamado Wakasa se muda a la bañera de la casa de Tatsumi. Wakasa es algo egocéntrico pero apuesto, mientras que Tatsumi es genial pero entrometido.
