Michiko es una "Sexy-Diva" con un alma libre que logra fugarse de una fortaleza [cárcel] que parecía inexpugnable. Hatchin es una niña que vive con una familia adoptiva, en donde es despreciada y maltratada. Ahora la morena va a por la niña y ambas se unen hacia un destino inimaginable.
Takasu Ryuuji comienza su segundo año de instituto con mucho animo. Sin embargo, hay una cosa que el odia, y es su mirada, heredada de su padre (un ganster), con lo cual posee una habilidad innata para intimidar a los demás, provocándole esto muchos malentendidos con sus compañeros, no obstante, todo esto va cambiar el primer día de clases, cuando Ryuuji tiene un encontronazo con Aisaka Taiga, la persona mas peligrosa del centro.
La historia comienza cuando el Dr. Akamashi, científico al servicio del gobierno, lanza un ataque de estado al Reino de Forland. En su lecho de muerte, el rey de Forland envía a su hija, la princesa Alita Forland, a buscar a su hermano Kaito, que está fuera del reino en una misión diplomática. Alita huye del castillo y consigue llegar al bosque. Cuando los guardias que acompañan a Alita son atacados por una bestia del bosque, Alita sale corriendo del bosque y tropieza con Faris, una cazarrecompensas, y éstas caen juntas por un barranco. Debido a la experiencia cercana a la muerte que han vivido las dos juntas, intercambian sus cuerpos. Por ello, la cazarrecompensas Faris deberá proteger el Reino de Forland por Alita y así nacerá su leyenda como "Murder Princess(la princesa asesina)".
La historia de Strawberry Panic se centra en un mundo de mujeres, Astraea Hill. Aoi Nagisa ha sido trasladada a St. Miator's Girls' Academy, una escuela que comparte el campus y los dormitorios con otras dos academias: St. Spica's Girls' Institute y St. Lulim's Girls' School. Al llegar, se da cuenta de lo fascinante que es su nueva escuela y de inmediato se siente atraida por la seducción de la Etoile de Astraea Hill (Shizuma Hanazono). Conforme se desarrolla la historia, Nagisa descubre más sobre el colegio, sus compañeras y la triste historia que esconde Shizuma tras su amable y conquistadora sonrisa.
La historia comienza en una ciudad llamada Romdo en la cual habitan humanos y unos robots denominados ?Autoraves?, pero luego ocurren una serie de asesinatos causados por Autoraves infectados con un virus denominado ?Cogito?, el cual dota de emociones a los robots. ?Vincent? un inmigrante encargado de eliminar autoraves infectados se ve involucrado con uno llamado ?PINO? la cual es acusada de causar la infección en la ciudad. Mediante las investigaciones ?Lil Mayer? llega a Vincent del cual se desconoce su pasado, mientras tanto Vincent y pino son expulsados de romdo , Lil comienza a dudar sobre las leyes de la ciudad y decide ir a buscarlo lo que la lleva a comenzar un viaje lleno de secretos y situaciones inesperadas junto a Vincent y pino por el mundo en busca del pasado de Vincent, donde descubrirán a un mundo debastado pero con vida y a unos humanoides denominados Proxys que pueden ser la salvación del mundo.