En el Viejo Oeste Americano, la mayor carrera del mundo está a punto de comenzar. Miles de personas se alinean en San Diego para recorrer más de seis mil kilómetros por la oportunidad de ganar el gran premio de cincuenta millones de dólares. Con la era del caballo llegando a su fin, se permite a los concursantes usar cualquier tipo de vehículo que deseen. Los competidores tendrán que soportar condiciones agotadoras, viajando hasta cien kilómetros al día a través de desiertos inexplorados. La Steel Ball Run es, sin duda, un evento único en su tipo.
El joven Johnny Joestar, un ex corredor de caballos discapacitado, ha venido a San Diego para presenciar el inicio de la carrera. Allí se encuentra con Gyro Zeppeli, un corredor que lleva dos bolas de acero en la cintura en lugar de un arma. Johnny observa cómo Gyro utiliza una de sus bolas de acero para desatar un poder fantástico, obligando a un hombre a dispararse a sí mismo durante un duelo. En medio de la acción, Johnny toca accidentalmente la bola de acero y siente un poder surgiendo a través de sus piernas, lo que le permite levantarse por primera vez en dos años. Prometiendo encontrar el secreto de las bolas de acero, Johnny decide participar en la carrera, y así comienza su extraña aventura a través de América en la Steel Ball Run.
Midori está en un aprieto. Tiene deudas y su casera intenta extorsionarla por alquileres impagados. Su mejor amiga se niega a prestarle dinero ya que ha descubierto sus trucos. Tal vez un poco de acoso podría ayudar. ¿O un poco de robo menor? Ninguna de las dos opciones es sostenible. Quizás conseguir un trabajo resolvería las cosas... Pero trabajar significa menos tiempo para divertidas aventuras en la gran ciudad...
En una ciudad flotante donde los ricos se deshacen de su basura y de las personas, a Ludo lo acusan de asesinato y lo arrojan al Abismo, un infierno habitado por las bestias de la basura. Para sobrevivir, deberá hacer uso de un nuevo poder y unirse a los Limpiadores. El objetivo de Ludo no es solo acabar con los monstruos, sino también con aquellos que lo arrojaron al Infierno.
Los mejores amigos Yoshiki y Hikaru han estado pegados el uno al otro como si fueran una sola persona durante la mayor parte de sus vidas. Viviendo en un pequeño pueblo y siendo los únicos niños de su edad, los dos chicos encuentran consuelo en la compañía del otro. Su amistad parece idílica a simple vista, pero Yoshiki ha notado un cambio en el comportamiento de Hikaru desde un verano fatídico.
El "Hikaru" que se sienta a su lado ahora no es nada parecido a su amigo. A pesar de que su apariencia física y recuerdos permanecen exactamente iguales, Yoshiki sabe que algo no está bien y que el Hikaru que conocía se ha ido. Cuando menciona esto, Hikaru se transforma parcialmente en un ser de otro mundo, amenazando con matar a Yoshiki si no puede aceptarlo, mientras también le profesa su amor.
Afectado por el dolor y sin poder dejar ir a su mejor amigo, Yoshiki lucha por seguir adelante con su vida mientras se siente cada vez más cerca del nuevo Hikaru. Al mismo tiempo, extraños acontecimientos comienzan a asolar su pueblo, trayendo un caos inquietante.
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